耕地占用税和土地使用税是不同的税种，不存下重复缴纳的问题。根据土地使用税的规定，凡是缴纳了耕地占用税的，从批准征用之日起，满一年后征收土地使用税。贵公司可以查看是否符合土地使用税的免税规定，不符合免税条件的话，则需要加纳土地使用税。
