有机磷酸盐的处理比较繁琐，有三种思路进行去除。
第一，是通过生化的方法将有机磷分解为正磷，而后通过除磷剂沉淀去除，但是在实际处理中由于电镀废水可生化性比较差，有机磷转化为正磷的效率较低，因此效果欠佳;
第二，是通过高级氧化技术将有机磷分解为无机磷，而后通过沉淀去除，此种方法应用较多，常见的高级氧化技术如芬顿氧化技术、臭氧氧化技术等。
第三，也是最省事的方式就是更换电镀的前处理药水，使用不含磷的添加剂，目前国内很多电镀工业园区都禁止使用含有机磷的除油粉，以避免对废水处理带来难度。
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