数据库和web文件一般是分开放的，不会放到同一个文件夹里的，除非你用的是 access数据库，不需要考虑安全性；
mysql 一般是配合 php 做网站用的
mysql数据库存放的地方是安装mysql的文件夹里，而web可以随你放任何地方，只要配置apache的网站路径指定到你的web资料就可以，只有如果在php里访问mysql， 如果是在本机安装了mysql ， 访问ip 用localhost 就可以连接到数据库，不必考虑mysql数据存放在哪里，当然如果你想移动网站到另一台电脑上，那你可以到安装mysql的资料夹 MySQL\data 里 找到你的web数据库文件
如果你是从别人那购买php空间，当然也要购买mysql空间， 这2个空间不是同一个空间！
可以合并一起，但会影响运行速度，之所以怎么用，要看你的用途，如果访问量过大，还是独立为好。
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