先天性甲状腺功能低下是由于胚胎期和出生前后，甲状腺的发生、发育和功能代谢异常，引起生后甲状腺功能减退，从而导致脑和体格发育严重损害，是儿科最常见内分泌疾病之一。 发生这种情况的的原因主要是甲状腺先天性发育不良、缺如、异位、甲状腺激素合成障碍、碘缺乏等，暂时性甲低则是孕母或新生儿出生后接触含碘化合物，、母亲服用抗甲状腺药物、母亲抗甲状腺抗体等因素的影响，这些因素消失后可以恢复正常。
