我在学校用的名字和户口本上的不一样该怎么办呢？

必须改一方。
现在不改，将来升学，办户口，办身份证等都办不成。
学校的改相对容易。但必须是起始年级。如初中一年级、高中一年级。否则手续极为麻烦。
如果中途改户口本，需要学校出证明，需要找派出所户籍室，才能改。

凡18岁以下未成年人将乳名改为大名，应由监护人或法定代理人提出书面申请，经责任区民警核实，报县局审批后，予以变更更正；18岁以上成年人变更姓名，由本人提出书面申请；是干部、职工的，还需提供所在单位人事劳动部门出具的准予变更的证明，经责任区民警审查认定理由正当的，报县局审批后，方可给予变更；学校可由校方提供变更证明，一般是在校保卫处办理。
请你将户口簿、身份证及相关材料到户口所在地的派出所申请，派出所要7个工作日，县局要17个工作日。
建议：致电学校所在地派出所和户口所在地派出所，询问具体程序。
如果是大学，以后的学位证就会按学校的名字给

以后这个证就不好办了
如果你现在没上大学
去户口所在地的派出所改一下还是满方便的，让派出所开个证明去学校改了，早改早好

去户籍地的派出所出具证明 要看你想用哪个名字 可以申请修正

凡18岁以下未成年人将乳名改为大名，应由监护人或法定代理人提出书面申请，经责任区民警核实，报县局审批后，予以变更更正；18岁以上成年人变更姓名，由本人提出书面申请；是干部、职工的，还需提供所在单位人事劳动部门出具的准予变更的证明，经责任区民警审查认定理由正当的，报县局审批后，方可给予变更；学校可由校方提供变更证明，一般是在校保卫处办理。
请你将户口簿、身份证及相关材料到户口所在地的派出所申请，派出所要7个工作日，县局要17个工作日。
建议：致电学校所在地派出所和户口所在地派出所，询问具体程序。