无论是全额还是差额，都不得开具增值税专用发票。根据《国家税务总局关于明确中外合作办学等若干增值税征管问题的公告》（国家税务总局公告2018年第42号）规定，自2018年7月25日起，航空运输销售代理企业提供境内机票代理服务，以取得的全部价款和价外费用，扣除向客户收取并支付给航空运输企业或其他航空运输销售代理企业的境内机票净结算款和相关费用后的余额为销售额。航空运输销售代理企业就取得的全部价款和价外费用，向购买方开具行程单，或开具增值税普通发票。
一般纳税人按代理服务交增值税，收取的手续费可以向企业客户开具增值税专票。机票款由航空公司开票，客运服务不能抵扣，所以开普票。
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