氯仿:RNA脱离DNA及蛋白，从混合液中层析到水相.水相中的RNA可用异丙醇沉淀浓缩.接着用异丙醇进行二次沉淀，随后用乙醇洗涤沉淀，可去除所有残留的蛋白质和无机盐.RNA样品中如果含有无机盐,有可能对后续实验操作中的一些酶促反应产生抑制作用。
