农村的不动产,也是由政府不动产登记部门办理的。具体是市县的国土资源管理部门下的不动产登记机关。
在当地的不动产登记中心办理。我们这里处理业务的话是,新办房产证在基层的国土所就可以办理,然后房屋变更登记,转移登记等等就是准备好资料到不动产登记中心办理。所以你可以根据自己办理的具体业务,去咨询一下你们当地的不动产登记中心