1对方涉嫌聚众斗殴罪，你父亲可主张正当防卫而不构成犯罪。2即使你和对方签了那份协议，如果对方构成犯罪，那么不再追究邻居刑事责任的协议也是无效的。3邻里之间发生纠纷打架的一般不按故意伤害罪认定，而由公安机关予以治安处罚，当然也可能定刑。4只有法院才有审判权，其他机关一律无权定罪。5如果真的检察院起诉了，一定要主动赔钱，争取缓刑。
法学本科学生，所学有限，希望能帮到你们。
依你所述情形，有办案人员徇私枉法的可能，建议你及时找律师介入处理。因为很多细节都没有，无法做出准确的判断。
应当对你叔叔的伤情做初步判断，构成轻伤以上对方也是要承担刑事责任的。
是否同意对方的条件，你要自己决定。
双方均有过错，关键是你叔叔的伤情程度，建议请你们当地律师介入
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