适宜的含水量是金针菇菌丝生长和子实体发育的重要因素，金针菇栽培袋含水量需一次性调节好，子实体发育所需的水分绝大部分从栽培料中获得，不能像其他覆土栽培菌类或脱袋栽培种类那样从土壤或喷水过程重新获得水分。
金针菇栽培料理论含水量是60%～65%。实践证明，当栽培料含水量超过65%时，栽培料通气性降低，菌丝蔓延速度减缓，子实体含水量相应增加。培养料含水量低于57%，子实体发育水分供应不足，菇体生长缓慢，菌盖变大，子实体含水量相应减少。
一般情况下，袋栽培养料的含水量控制在62%左右较为适宜。培养料采用高压灭菌时可略高1%～2%；夏季栽培时培养料的含水量略低1%～2%；瓶栽培养料的含水量略高1%～2%。
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