明末，蒙古最大的势力是“统领四十万蒙古国主林丹汗”，主要地盘位于内蒙古赤峰一带。此人是元朝皇帝直系后裔，元朝的传国玉玺就在他这一支蒙古贵族手中。但很不幸的是，他本人输给努尔哈赤，他的后代又输给皇太极，所以内蒙古顺理成章地被后金吞并。外蒙古原本并不臣属于满清，但在康熙皇帝时，新疆北部强大的准格尔汗国大汗噶尔丹入侵，外蒙各部无力抵抗，需要寻求外部助力，此时可以噶尔丹相抗衡的势力有两股，一为俄罗斯，二为满清，由于宗教上的原因，蒙古活佛主张归顺清朝，其余贵族接受了他的建议，外蒙古也就此归入了清朝版图
蒙古当时已经不再强大了，四分五裂，各自为战，实力大减，明朝大将李成梁几次讨伐将他们打的落花流水，而建州女真八旗统一女真各部后，实力倍增，软硬兼施，迫使蒙古结盟自然不在话下。
清朝建立以后，更是拥有了他们以前无法想象的巨大人力物力，而作为盟友的蒙古各部仍然是各自为战，所以虽有反抗，也成不了气候。
一、清朝初年，蒙古仍然处于各部分裂状态
二、畜牧业为蒙古主要的经济来源，而以葛尔丹为代表的草场争夺极大地削弱了蒙古牧民的战斗力
三、葛尔丹的草场争夺排挤了大量小部落，而这些小部落就投靠了清政府，使清政府更加细致地了解蒙古内部的利害关系，并各个击破
可能当时清朝拳头大吧！
不臣服就要被灭了
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