由于3号线跨越合肥西南至东北两端，因此与其相交的换乘站点颇多。其中，在合肥站与1号线换乘，在潜山路站与2号线换乘，在祁门路站与规划4号线换乘，在蒙城路站与规划5号线换乘，在望江西路站与规划6号线换乘，在繁华大道站与规划7号线换乘。
