直到嘉庆和道光两朝，清漪园仍然保持着乾隆时期的规模、内容和格局，只有极个别的建筑物的增损和易名。例如在嘉庆年间，改惠山园之名为谐趣园并加建涵远堂，霁清轩内加建军机房，拆除乐安和，拆除南湖岛上的望蟾阁改建为涵虚堂。
道光年间又平毁凤凰墩上的会波楼及配殿，为节约宫廷开支曾一度撤去各殿宇内的陈设和铺垫等。
