南昌大学第二附属医院领先及建设学科13个，江西省市共建学科7个。心血管内科、神经内科、普通外科、心胸外科、骨科、眼科、小儿眼科等专科特色明显。心血管内科是国家临床重点专科和国家卫计委心律失常、冠心病、先天性心脏病介入诊疗培训基地。
