医院历史悠久，底蕴深厚，前身是1929年创立的国民政府中央医院，1939年迁至重庆。1945年在学田湾设立国民政府中央医院城区门诊部，1947年该门诊部迁至现址，更名为国民政府中央医院重庆城区分院，1955年正式命名为重庆市第三人民医院。
