档案还在学校。学费应该不用再交了，因为06-07学年的学费你应该已经交掉了，08-09学年因为你未按时注册，你的学籍应该已经注销也不用再交纳学费。你现在应该到学校补办理退学手续，完成后学校将你的档案退到原籍所在地。
