无花果的根系由不定根、侧根和须根组成，无主根。其根系在土壤中分布较浅，垂直分布在15～60厘米土层。水平根群横向扩展范围10米左右。随树龄增长和树冠扩大，根系伸展不断加深，土层深厚的地区，根系可下扎1～2米。土壤透气良好，氧气供应充足，根系粗壮，根毛多，吸收能力也强。
无花果根系的伸长、充实和呼吸强度有关。土温10℃左右根系开始活动。在江苏，5月中旬为活动盛期，6月中旬为生长高峰期；5月中旬至6月下旬是春根生长最快的时期。8月上中旬盛夏干旱，根系暂停生长，8月下旬至10月再次生长，产生秋根。11月下旬至12月上旬，地温低于10℃以下时根系停长。
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