A、样方大小对种群数量有一定的影响，乔木100m2、灌木16m2、草本1m2，A错误；B、样方法最主要的是进行随机取样，要想使取样具有代表性，就必须保证取样是随机的，如果带有主观因素，那所测的数据会不准确，B正确；C、取样方法对种群数量有定的影响，根据地段的不同可因地制宜采用不同的取样法，如正方形的地段采用五点取样法，C错误；D、长方形的地段采用等距取样法，取样方法对种群数量有定的影响，D错误．故选：B．
