发酵工程的特点是：
采用现代工程技术手段，利用微生物的某些特定功能，为人类生产有用的药品，或直接把微生物应用于工业生产过程的一种新技术。
发酵工程制药的工艺过程包括菌种的选育、培养基的配制、灭菌、扩大培养和接种、种子罐（空灭--配制培养基--实灭--无菌接种）扩大培养、发酵（空灭--配制培养基--实灭--无菌接种，通往无菌空气进行有氧发酵）生产和药品的分离（等电点法、离子交换法、溶媒萃取法等）、提纯（重结晶法）、干燥（喷塔、气流、烘干等）。包装（纸筒、铝筒、袋装等）等方面。
生物制药，反应的专一性得到了有效的提高。。。
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