优点：灵敏度高，可以用于扫描液相荧光标记物所发出的荧光光谱，不但可以做一般的定量分析, 而且还可以推断分子在各种环境下的构象变化, 从而阐明分子结构与功能之间的关系。缺点：1、荧光的光强并不高，所以呈线性情况有时不很理想；2、某些反应荧光持续的时间较短；3、荧光的发散方向不集中，不像透射光那样集中，强度高；4、受某些离子的干扰影响，荧光会湮灭，试验速度必须要快。
