首先我先看看我理解的问题对不对：你说的RT-PCR是指reverse transcription PCR。
那么这种PCR属于半定量PCR，它的定量结果只能全部跑完PCR（终点法）以后，通过琼脂糖电泳的方式，观察最终的核酸条带的亮度，来反映mRNA的量。
荧光定量PCR（real-time RT-PCR）可以实时监测PCR的扩增过程，通过达到某个荧光阈值的循环数来反映模板（mRNA）的含量，这种方式比终点法的定量更具有准确度度。
因为终点法的结果收到更多的因素干扰（如：酶活等因素），即使是同样的模板，可能最终的条带亮度都不一致，但是荧光定量PCR的结果，在PCR循环的前期，收到多种因素的干扰小，更准确的反映模板含量的不同。
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