首先，抗体检测方法不适用于诊断母亲是HIV阳性的新生儿，因为这些新生儿体内存在母体的抗HIV抗体。大约经过12个月，新生儿体内的母体来源的抗体减弱消失，诊断新生儿自身的抗体才有可能。其次，感染HIV的新生儿，在12个月的时候，其母体抗体已经消失，大约18个月的时候才产生自身的HIV抗体。如果HIV抗体检测用于新生儿艾滋病检测的话，建议可以在十二个月以后进行第一次检测，等到十八个月后HIV抗体检测阴性结果，才能完全排除婴儿的艾滋病感染的可能性。
