动物管理局主要讲述了故事主人公，由陈赫饰演的郝运，阴差阳错之下发现繁华的都市中竟然存在妖怪，这颠覆了他的认知观。在发生的一系列事件中，郝运被迫加入了维护人、妖和谐共处的机关单位，表面是动物管理局，其实又叫妖怪管理局。自从郝运成了维护人之后，他的生活发生了翻天覆地的变化，各种妖魔鬼怪轮番上阵，碰到了各色各样的妖怪，有好的，也有坏的，一桩桩诡异案子有时候并非人为，而是邪恶的妖怪所为。妖怪的世界就如人的一样，他们并非都是洪水猛兽，过得生活也是柴米油盐，也有情感方面的悲欢离合，而作为人类的郝运在接触各类妖怪之后，其心态也发生了变化，还和他们成为朋友、恋人等等···
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