你概念混了啊。。是三个碱基决定一个氨基酸，氨基酸脱水缩合盘曲折叠后才能形成蛋白质。碱基是小分子，氨基酸是生物大分子。另外，氨基酸密码表中就是三个碱基对应一种氨基酸，你非要问为什么非得是三个。。这问题就像是人为什么不长三只眼睛。很明显，这是长期进化的结果。
不是三个碱基决定一种蛋白质，而是三个碱基决定一种氨基酸，不同的氨基酸进行组合，折叠形成不同的蛋白质
因为如果是三个对一个的话可能性为4的3次方，就是64。刚好满足科学家发现的可能性。而4对1的话就是4的4次方了。
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