这种情况要看你嫌不嫌麻烦了。如果不想扯太多,就把多出的部分自负了,这样比较方便。按正常情况,对方是理亏的,因为可以维修的部件就换的话是扩大了损失,这个责任应该对方付。用个夸张的比喻,对方换辆新车你赔不赔?所以,不怕麻烦就是拒付,保险公司有拒付你的理由,你直接给对方就行,对方不服,可以起诉。法院判你付,你就要求保险公司付(理由相同),法院判对方承担,你就没什么事了。
除了营运车辆不存在误工费问题,也没有法律依据,不要给他,只负责修车,他要不依不饶就叫他到法院起诉你。