《环境工程微生物学》分三篇，第一篇为微生物学基础，介绍微生物的个体、群体特征；生理生化特性；生长特征、遗传变异等分子生物学和分子遗传学基本原理；第二篇为微生物生态与环境生态工程中的微生物作用，介绍在环境工程中各种生物处理方法的微生物机理；如何应用微生物基础知识分析和解决工程中发现和出现的问题；介绍固定化微生物、微生物絮凝剂、沉淀剂等的开发与应用，以及微生物能源的开发与应用。第三篇为实验，其内容具有基础性、可操作性和实用性。
