1、 树形上。花椒树形比较松散，枝条较粗壮而长，麻椒树形相对紧簇一些，枝条细弱一些。
2、 叶片上区别。花椒叶片较厚，多为7-9片羽状复叶，甚至11-13片，叶柄翅上无羽状，尔麻椒相对较薄，多为3-5片羽状复叶，且叶柄上有羽状翅。
3、 果实区别。鲜果实颜色没有大区别，花椒果皮顶端很少有残留的花柱，麻椒几乎全部保留花柱;花椒果皮有气孔无瘤状突起，麻椒瘤状突起特别明显，果皮在光线下有许多亮点。干花椒颜色发红，干麻椒发褐色。
4、 口感。花椒香味浓烈，但是麻味稍逊色，麻椒以麻为主，麻时间较久。 到了冬季，树木落叶后，麻椒部分枯叶不落地，也有的小树苗依然青翠。
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