南极洲的湖泊也很有趣，它们主要分布在沿岸地带的绿洲里，多为出口湖而且水质较咸。有的湖水盐分是海水的12倍，以致湖水在零下70℃时仍不冻结。这些湖泊大体可分三种类型：一是湖面被冰封冻，处在冰层与岩石之间，称为“冰下湖泊”；二是夏季湖面冰层解冻，露出湖水，称为“季节性湖泊”；三是咸水湖，由于盐分很高，尽管严寒的冬季，湖水仍不冻结。南极大陆的河湖中，生物极为贫乏，只有夏季才有淡水藻类生长（例如蓝绿藻）。此外，在水生环境中还可见到能忍受长期封冻低温的轮虫纲动物。
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