（1）臭豆腐制作过程中所用的微生物主要是毛霉，表面有一层致密的皮，属于毛霉的白色菌丝，包括直立菌丝和匍匐菌丝．它对人体是无害的，在多种微生物的协同作用下，豆腐就转变成了风味独特的腐乳．
（2）利用选择培养基的功能筛选，加入有机磷农药；稀释涂布平板法对初步筛选得到的目的菌进行纯化并计数．
（3）Taq细菌为PCR技术提供了耐高温的DNA聚合酶，这说明在寻找目的菌时要根据它对生存环境的要求去寻找．实验室中微生物的筛选，也应用了同样的原理，即人为提供目的菌生长的条件，实验室培养微生物的培养基一般都含水、碳源、氮源及无机盐等主要营养物质．
（4）微生物培养过程中，获得纯净培养物的关键是防止外来杂菌污染，干热灭菌对培养皿进行灭菌．
故答案为：
（1）毛霉 匍匐菌丝（或基内菌丝） 协同
（2）有机磷农药 稀释涂布平板法
（3）耐高温的DNA聚合酶 水、碳源、氮源及无机盐
（4）防止外来杂菌污染 干热灭菌法
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