商贸企业辅导期增值税一般纳税人进项税额抵扣实行“先比对，后扣税，“先比对，后抵扣”是指辅导期一般纳税人企业取得的增值税进项发票认证后，先通过防伪税控系统将认证信息上传至总局进行比对，总局比对结束后将比对结果下发各省市，各主管国税局将比对无误的信息通知辅导期一般纳税人企业进行抵扣（一般在认证的次月收到比对结果）。
辅导期增值税一般纳税人在应交税金科目下增设“待抵扣进行税额”二级科目。帐务处理如下：
企业认证后
借：库存商品（或其他相关科目）
借：应交税金-待抵扣进行税额
贷：银行存款（或其他相关科目）
收到比对结果后
借：应交税金-应交增值税（进项税额）
贷：应交税金-待抵扣进行税额
辅导期一般纳税人由于实行“先比对，后扣税”，因此第一个月没有进项可抵，第一个月的增值税就是收入乘以增值税税率（17%或13%），最好的办法第一个月只开进进货的增值税发票，不开具销售发票（含增殖和普通）或只开具少量的发票。
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