由于缺乏管理和维护,府学文庙一度破损严重。2005年,济南市正式启动府学文庙的修复工程,对其进行整体修复。其间,共修葺或恢复包括大成殿在内的大小古建数十间,部分恢复了历史上府学文庙中轴线上建筑群。
在修缮保护工程中,专业人员对于现存建筑,按照文物保护的办法进行修葺;需恢复历史上存在的古建时,依托历史资料以及考古发掘,并按照传统建筑的构建办法施工。但有时候,专业技术人员也必须根据实际情况,拿出更科学的保护方案。如在维修大成殿时,由于多年来大成殿外的地面升高,一旦降雨,大成殿内地面将被淹没,不利于文物的保护。针对这种情况,专业技术人员将原建筑编号拆解,整体抬高1.55米后,按照原样重新构建起来,这就解决了雨水浸泡的问题。
在恢复古建环节,专业人员搜罗大量与文庙有关的图文资料,对这片古建的历史面貌有了一个较为清晰的认识。通过图片和发掘,确定了拣门、东西廊庑、东西御碑亭以及钟英坊、毓秀坊等历史古建的原貌。进一步探究发现,早在上世纪五十年代,尊经阁就已经只剩下遗址,埋藏在明湖路的路面下,而明伦堂还在。为此,技术人员赴山西等地,参照当地孔庙内的尊经阁样式,恢复了这座古香古色的古建筑。
据介绍,大成殿内的天顶彩绘,也是按照官式彩绘来绘制的,使用旋之金线点金技法,这种彩绘技法尽管与故宫彩绘相比尚低两个档次,但“点金”本身已属较高规格。