1、酯酶是催化酯水解的酶；脂肪酶是催化脂肪水解为甘油和脂肪酸的酶。2、作用底物的碳链长短不同：酯酶优先水解短链脂肪酸，脂肪酶优先水解长链脂肪酸。3、作用底物的物理状态不同：酯酶水解水溶性底物，脂肪酶水解油水界面的底物。
