原核生物有氧呼吸产生水在细胞膜上.部分能进行有氧呼吸的原核生物，从形态学上看，细胞膜向内折叠成嵴，其上附着有小颗粒，这些小颗粒就是有氧呼吸的多酶体系。其过程不同的生物存在差异。真核生物的线粒体可以看成是被真核细胞俘获的能进行有氧呼吸的原核细胞。
原核生物细胞能进行有氧呼吸。有的原核生物，如硝化细菌、根瘤菌，虽然没有线粒体，但却含有全套的与有氧呼吸有关的酶，这些酶分布在细胞质基质和细胞膜上，因此，这些细胞是在胞膜上有氧呼吸的
