信用卡恶意透支，本质上是贷款合同纠纷，无论多少数额，银行都有权到法院起诉追讨欠款。是否起诉，由银行自己决定。
如果真起诉你会是刑事案件，你涉嫌诈骗恶意透支了未还，钱是国家的肯定是刑事案件。但是5000额度没有还才两个月，银行应该不会起诉你，估计是吓唬你叫你尽快还钱而已，想办法尽快还就好了。
