616主世界是被一只放射性的蜘蛛咬到大拇指根部，蜘蛛毒液让他发生变异
至于另外两个电影世界
老三部曲是pp被基因工程改造过的蜘蛛（三种蜘蛛的基因合在一起创造出一种新蜘蛛）咬了大拇指指根
新的超凡蜘蛛侠两部里pp是被他父亲理查德-帕克用自己的基因混入蜘蛛基因而造出的一种转基因蜘蛛，只有有他的基因的人（就是他自己或者他的后代）被咬了才会变异，其他人被咬了多半会死。这只蜘蛛咬了彼得的颈椎附近。
至于2017.7.7的蜘蛛侠homecoming，制片方貌似不打算介绍蜘蛛侠起源，因为他们认为这已经大众皆知了～
望采纳哟～
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