A、酸雨可以使河流和湖泊酸化，酸化的水源威胁着人们的健康，影响人们饮用，A正确；B、酸化的水源影响鱼、虾等水生生物的生长发育，B正确；C、酸雨直接危害芽和叶，使出现酸雨地区的植物全部死亡，C正确；D、酸雨使土壤中的养分发生化学变化，不利于植物吸收利用，D错误；故选：D．
