这两个词，在作副词用、表示“唯有”这个意思的时候，作用是一样的，比如：1、A组只有（仅有）两人潜到60米的深度。2、到深圳的时候，他的口袋里仅有（只有）224元钱。但是，在多数情况下，“只有”是作为连词，与“才”搭配，来表示一种条件关系，如：1、只有社会主义才能救中国。2、只有从源头上治理，才能解决环境污染问题。这时候，“仅有”就无能为力了。
