师徒间的矛盾是,孙悟空有火眼金睛一看就知道那一家三口都是妖怪为了吃唐僧而变化,为了师父的安全,不被妖怪吃了,要三打白骨精,而唐僧肉眼凡胎,不知道那一家三口都是妖怪,认为那一家三口都是好人,孙悟空是胡乱杀生,犯了佛家的杀戒,所以才会有这个矛盾。