按政策来讲，只能首套房贷才可以抵扣，但您已申请退税证明是可行的，大不了在补缴回去。
1，没有影响的吧，系统能审核通过，说明系统只认为你只有一套房子，2，除非你在申报时故意隐瞒只有一套房子，日后报税系统人工复核时，会联系你补交税款。
