①参与ATP形成的化学元素包括C、H、O、N、P，①正确；
②衣藻和黑藻细胞能进行光合作用和呼吸作用，故产生ATP的场所有细胞质基质、叶绿体和线粒体，②正确；
③小麦根尖只能进行呼吸作用，细胞质基质不是细胞器，故产生ATP的细胞器是线粒体，③错误；
④植物能进行光合作用和呼吸作用，动物和微生物一般只能进行呼吸作用，故ATP在植物、动物和微生物体内来源不同，④错误；
⑤ATP断裂了所有高能磷酸键之后可作为合成核糖核酸的基本单位之一，⑤错误；
⑥人在饥饿时，细胞中ATP和ADP仍能达到动态平衡，⑥正确．
所以①②⑥正确．
故选：B．
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