①用样方法调查植物种群密度时，取样的关键是随机取样，排除主观因素的影响，①正确；
②研究土壤中小动物类群丰富度时用取样器取样调查法，②错误；
③在电子显微镜下拍摄到的叶绿体的结构照片属于实体，模型比较直观，电子显微镜看的不直观，③错误；
④孟德尔遗传规律的研究过程以及摩尔根果蝇眼色遗传的研究，均用到了假说演绎法，④正确．
⑤在探究生长素类似物促进插条生根的最适浓度实验中，用浸泡法处理时要求时间较长、溶液浓度较低，沾蘸法是把插条基部在浓度较高的药液中蘸一下，时间较短，⑤正确．
⑥调查人群中某遗传病发病率时，随机选取调查对象，对单基因遗传病进行调查，⑥错误．
⑦观察统计多个装片、多个视野的细胞，多个视野统计后取平均值都可减少因偶然因素而造成的误差，可以比较有丝分裂细胞周期不同时期的时间长短，⑦正确．
故选：C．
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